Лиманський О.

Надсуперспіралізація та компактизація суперспіральної ДНК

Цитология и генетика 2005, том 39, N 2, 64-71

Суперспиральная ДНК pGEMEX длиной 3993 пары нуклеотидов, иммобилизованная на различных субстратах (свежесколотая слюда, стандартная и модифицированная аминослюда), была визуализирована посредством атомно-силовой микроскопии. На модифицированной аминослюде были визуализированы как плектономические молекулы суперспиральной ДНК, так и молекулы с чрезвычайно высоким уровнем компактизации, значение суперспиральной плотности которых значительно выше по сравнению с ранее достигнутыми экспериментально и рассмотренными теоретически. При повышении уровня компактизации ДНК длина оси сверхсуперспирализованных молекул уменьшается от ~ 390 до ~ 140 нм с последующим образованием тороидов диаметром ~ 50 нм и молекул в сферической конформации. На основе анализа полученных изображений предложена модель возможных конформационных переходов суперспиральной ДНК при возрастании плотности суперспирализации.