Филипенко Е.А., Филипенко М.Л., Дейнеко Е.В., Шумный В.К.

Анализ сайтов встраивания Т-ДНК инсерций у трансгенных растений табака

Оригинальная работа 

• Институт цитологии и генетики Сибирского отделения Российской академии наук, пр-т Лаврентьева, 10, Новосибирск, 630090
• Институт химической биологии и фундаментальной медицины Сибирского отделения Российской академии наук, пр-т Лаврентьева, 8, Новосибирск, 630090

Цитология и генетика 2007, том 41, N 4, 3-8

Проведено клонирование прилежащих к трансгену областей геномной ДНК, выделенной из 17 трансгенных растений табака методом «инвертированной» ПЦР. В результате анализа первичных последовательностей 34 клонированных фрагментов ДНК установлено, что 10 из них имели 100%-ную гомологию с векторными последовательностями, не входящими в Т-ДНК область. Девять полученных нуклеотидных последовательностей имели гомологию с повторяющимися последовательностями в геноме табака. Процент гомологии варьировал от 70 до 90 %, причем идентифицированные повторы принадлежали к разным типам. Для большей части проанализированных фрагментов не выявлено гомологий с последовательностями, депонированными в базах данных. Выравнивание усеченных в процессе встраивания последовательностей левой и правой границ Т-ДНК-инсерций выявило значительную кластеризацию (в районе десяти нуклеотидов) сайтов усечения для левой границы. Необходимо отметить, что пять последовательностей имели идентичные сайты усечения +23Т, что свидетельствовало о предпочтительном использовании этого нуклеотида. АТ-содержание варьировало от 51 до 72 %, что было близко к суммарному проценту АТ пар в геноме табака.

Филипенко Е.А., Филипенко М.Л., Дейнеко Е.В., Шумный В.К. Анализ сайтов встраивания Т-ДНК инсерций у трансгенных растений табака // Цитология и генетика. – 2007. – 41, № 4. – С. 3-8.