Iourov I.Y., Vorsanova S.G., Yurov Y.B.

Fluorescence intensity profiles of in situ hybridization signals depict genome architecture within human interphase nuclei

Оригинальная работа 

• National Research Center of Mental Health, Russian Academy of Medical Sciences, Moscow, Russia
• Institute of Pediatrics and Children Surgery, Roszdrav, Moscow, Russia

Цитология и генетика 2008, том 42, N 5, 3-8

Представлен метод построения двухмерных (2D) и трехмерных (3D) профилей интенсивности сигналов флюоресцентной гибридизации in situ (FISH), основанный на количественной FISH. Настоящая методика была использована для анализа расположения и распределения сигналов в интерфазных ядрах клеток различных соматических тканей человека. Использование 2D профилей интенсивности продемонстрировало возможность определения колокализации FISH-сигналов. Более того, предложенный подход позволил идентифицировать реплицированные сигналы, дать оценку эффективности гибридизации и сравнительный анализ вариации содержания ДНК специфических участков хромосом. Построение 3D профилей показало распределение интенсивности в пределах площади сигнала. Применение этой методики позволило определить сосредоточение различных типов последовательностей ДНК: классическая сателлитная и альфоидная ДНК; геннонасыщенные (G-положительные полосы) и генноненасыщенные (G-отрицательные полосы) участки хромосом. Кроме того, методика дала возможность оценить расположение хроматина в интерфазных ядрах как культивированных, так и некультивированных клеток. В результате исследования был сделан вывод о том, что предлагаемый подход является эффективной дополнительной методикой для изучения ядерной организации, специфики вариации и расположения последовательностей ДНК в интерфазных ядрах, а также поведе- ния ядер при приготовлении хромосомных препаратов соматических клеток человека.

Iourov I.Y., Vorsanova S.G., Yurov Y.B. Fluorescence intensity profiles of in situ hybridization signals depict genome architecture within human interphase nuclei // Цитология и генетика. – 2008. – 42, № 5. – С. 3-8.