Цитологія і генетика 2020, том 54, № 6, 54-64
Cytology and Genetics 2020, том 54, № 6, 546–554, doi: https://www.doi.org/10.3103/S0095452720060043

Изучение коллекции яровой тритикале по устойчивости к бурой и стеблевой ржавчинам с использованием аллель-специфических маркеров

Ержебаева Р.С., Базылова Т.А., Бабисекова Д.И., Амангелдиева А.А., Таджибаев Д.Г., Ыдырыс А.

  • Казахский научно­исследовательский институт земледелия и растениеводства,
    040909, Республика Казахстан, Алматинская область,
    Алмалыбак, ул. Ерлепесова,1

Создание и использование устойчивых к ржавчине сортов является наиболее экологичным и эффективным способом защиты посевов пшеницы и тритикале. Для успешной селекции яровой тритикале на устойчивость к ржавчине необходимо иметь генетический материал с эффективными генами. С целью выявления носителей генов устойчивости к бурой и стеблевой ржавчинам была изучена коллекция яровой тритикале (86 образцов) с использованием молекулярных маркеров и методов фитопатологии. На искусственном инфекционном фоне 81 % коллекционных образцов яровой тритикале показали высокую устойчивость (0R) к популяции стеблевой ржавчины. Выделены 19 образцов, показавших устойчивость (0–5 %R) к популяции бурой ржавчины. Идентификация коллекции с использованием ДНК-маркеров позволила выделить образцы с геном Sr2 (19 образцов), Sr22 (9 образцов) и Lr28 (14 образцов). Среди  коллекции не обнаружены носители генов Lr9 и Lr35/Sr39. Образцы с эффективными генами Sr2 и Sr22 были включены в скрещивания для создания устойчивых к стеблевой ржавчине отечественных сортов.

Створення і використання стійких до іржі сортів є найбільш екологічним і ефективним засобом захисту посівів пшениці і тритикале. Для успішної селекції ярої тритикале на стійкість до іржі необхідно мати генетичний матеріал з ефективними генами. З метою виявлення носіїв генів стійкості до бурої і стеблової іржі була вивчена колекція ярої тритикале (86 зразків) з використанням молекулярних маркерів і методів фітопатології. На штучному інфекційному фоні 81 % колекційні зразки ярої тритикале показали високу стійкість (0R) до популяції стеблового іржі. Виділено 19 зразків, що показали стійкість (0–5 %R) до популяції бурої іржі. Ідентифікація колекції з використанням ДНК-маркерів дозволила ідентифікувати зразки з геном Sr 2 (19 зразків), Sr22 (9 зразків) і Lr28 (14 зразків). Серед колекції не виявлені носії генів Lr9 і Lr35/Sr39. Зразки з ефективними генами Sr2 і Sr22 були включені в схрещування для створення стійких до стеблової іржі вітчизняних сортів.

Ключові слова: яровая тритикале, коллекция, сорт, ржавчина, устойчивость, ген, молекулярный маркер

Цитологія і генетика
2020, том 54, № 6, 54-64

Current Issue
Cytology and Genetics
2020, том 54, № 6, 546–554,
doi: 10.3103/S0095452720060043

Повний текст та додаткові матеріали

Додаткові матеріали: 5460054s.pdf

Цитована література

1. Olivera, P.D., Pretorius, Z.A., Badebo, A., and Jin, Y., Identification of resistance to races of Puccinia graminis f. sp. tritici with broad virulence in triticale (Triticosecale), Plant Dis., 2013, vol. 97, no. 4, pp. 479–484. https://doi.org/10.1094/PDIS-05-12-0459-RE

2. Wojtowicz, A.,Wojtowicz, M., Sigvald, R., Czernecki, B., Ratajkiewicz, H., Lacka, A., Zacharczuk, M., and Pasternak, M., Assessment of the impact of climate change on the latency period of leaf rust on triticale in Poland, Acta Agric. Scand. Sect. B—Soil Plant Sci., https://doi.org/10.1080/09064710.2019.1696394

3. Herrera-Foessel, S., Singh, P.K., Singh, S., and Govindan, V., The emergence of Ug99 races of the stem rust fungus is a threat to world wheat production, Annu. Rev. Phytopathol., 2011, vol. 49, pp. 465–481. https://doi.org/10.1146/annurev-phyto-072910-095423

4. Rsaliyev, A.S., Rsaliyev, S.S., Principal approaches and achievements in studying race composition of wheat stem rust, Vavilov. Zh. Genet. Select., 2018, vol. 22, no. 8, pp. 967–977. https://doi.org/10.18699/VJ18.439

5. Shamanin, V., Salina, E., Wanyera, R., Zelenskiy, Y., Olivera, P., and Morgounov, A., Genetic diversity of spring wheat from Kazakhstan and Russia for resistance to stem rust Ug99, Euphytica, 2016, vol. 212, no. 2, pp. 287–296. https://doi.org/10.1007/s10681-016-1769-0

6. Rsaliev, Sh.S., Koyshybaev, M.K., Morgunov, A.I., and Kolmer, D., Analysis of the composition of the stem and leaf rust of wheat in Kazakhstan, in Modern Problems of Plant Protection and Quarantine: Collection of Articles of the Int. Scientific-Practical Conf., Almaty, 2005, pp. 267–72.

7. Stakman, E.C., Stewart, D.M., and Loegering, W.Q., Identification of Physiologic Races of Puccinia graminis var. tritici., U.S. Dep. Agric. Agric. Res. Serv. E-617, U.S., Washington: Gov. Print. Office, 1962.

8. Mains, E.B. and Jackson, H.C., Physiologic specialization in the leaf rust of wheat Puccinia tritici Erikss, Phytopathology, 1926, vol. 16, no. 1, pp. 89–120.

9. Peterson, R.F., Campbell, A.B., and Hannah, A.E., A diagrammatic scale for estimating rust intensity on leaves and stems of cereals, Can. J. Res., 1948., vol. 26, no. 5, pp. 496–500.

10. Dellaporta, S.L., Wood, J., and Hicks, J.B., A plant DNA minipreparation. Version II, Plant Mol. Biol. Rep., 1983, vol. 4, pp. 19–21.

11. Schachermayer, G., Siedler, H., and Gale, M.D., Identification and localization of molecular markers linked to the Lr9 leaf rust resistance gene of wheat, Theor. Appl. Genet., 1994, vol. 88, pp. 110–115. https://doi.org/10.1007/BF00222402

12. Gupta, S.K., Charpe, A., Koul, S., Prabhu, K.V., and Haq, Q.M., Development and validation of molecular markers linked to an Aegilops umbellulata-derived leaf-rust-resistance gene, Lr9, for marker-assisted selection in bread wheat, Genome, 2005, vol. 48, no. 5, pp. 823–830. https://doi.org/10.1139/g05-051

13. Naik, S., Giill, K.S., Rao, V.S., Gupta V.S., Tam-hankar S.A., Pujar, S., Gill, B.S., and Ranjekar, P.K., Identification of a STS marker linked to an Aegilops speltoides-derived leaf rust resistance gene Lr28 in wheat, Theor. Appl. Genet., 1998, vol. 97, pp. 535–540.

14. Cherukuri, D., Gupta, S., Charpe, A., Koul, S., Prabhu, K., Singh, R.B., and Singh Haq, Q.M., Molecular mapping of Aegilops speltoides derived leaf rust resistance gene Lr28 in wheat, Euphytica, 2005, vol. 143, pp. 19–26. https://doi.org/10.1007/s10681-005-1680-6

15. Mago, R., Zhang, P., Bariana, H.S., Verlin D.C., Bansal U.K., Ellis J.G., and Dundas, I.S., Development of wheat lines carrying stem rust resistance gene Sr39 with reduced Aegilops speltoides chromatin and simple PCR markers for marker-assisted selection, Theor. Appl. Genet., 2009, vol.119, pp. 141–150. https://doi.org/10.1007/s00122-009-1146-7

16. Gold, J., Harder, D., Townley Smith, F., Aung T., and Procunier, J., Development of a molecular marker for rust resistance genes Sr39 and Lr35 in wheat breeding lines, Electron. J. Biotechnol., 1999, vol. 2, no. 1, pp. 35–40.

17. Hayden, M.J., Kuchel, H., and Chalmers, K.J., Sequence tagged microsatellites for the Xgwm533 locus provide new diagnostic markers to select for the presence of stem rust resistance gene Sr2 in bread wheat (Triticum aestivum L.), Theor. Appl. Genet., 2004, vol. 109, pp.1641–1647. https://doi.org/10.1007/s00122-004-1787

18. Mago, R., Brown-Guedira, G., Dreisigacker, S., Breen, J., Jin, Y., Singh, R., Appels. R., Lagudah. E.S., Ellis. J., and Spielmeyer, W., An accurate DNA marker assay for stem rust resistance gene Sr2 in wheat, Theor. Appl. Genet., 2011, vol. 122, pp. 735–744. https://doi.org/10.1007/s00122-010-1482-7

19. Khan, R.R., Bariana, H.S., Dholakia, B.B., Naik, S.V., Lagu, M.D. Rathjen, A.J., Bhavani, S., and Gupta, V.S., Molecular mapping of stem and leaf rust resistance in wheat, Theor. Appl. Genet., 2005, vol. 111, pp. 846–50. https://doi.org/10.1007/s00122-005-0005-4

20. Yu, L.-X., S. Liu, J. A., Anderson, R. P., Singh, Y., Jin, J., Dubcovsky, G., Brown-Guidera, S. Bhavani, A., Morgounov, Z., He, J., and Huerta-Espino, M.E., Sorrells Haplotype diversity of stem rust resistance loci in uncharacterized wheat lines. Mol. Breed., 2010, vol. 26, pp. 667–80. https://doi.org/10.1007/s11032-010-9403-7

21. Gultyaeva, E.I., Orina, A.S., Gannibal, Ph.B., Mitrofanova, O.P., Odintsova, I.G., and Laikova, L.I., The effectiveness of molecular markers for the identification of Lr28, Lr35, and Lr47 genes in common wheat, Russ. J. Genet., 2014, vol. 50, no. 2, pp. 131–139. https://doi.org/10.1134/S1022795414020069

22. Tyryshkin, L.G., Zakharov, V.G., and Syukov, V.V., Comparative characteristics of Puccinia recondita Rob. ex Desm. syn.: Puccinia triticina Erikss. virulence in the Middle Volga region, Russ. J. Genet. Appl. Res., 2014, vol. 4, pp. 583–586.https://doi.org/10.1134/S2079059714060203

23. Gultyaeva, E.I., Shaidayuk, E.L., Kazartsev, I.A., and Aristova, M.K., Structure of Russian populations of Puccinia triticina, Plant Protec. News, 2015, vol. 3, no. 85, pp. 5–10.

24. Sochalova, L.P. and Lihenko, I.E., Evaluation of resistance to brown rust of lr-lines and varieties of wheat, isogenic in genes, under conditions of Novosibirsk region, Dostizh. Nauki Tekhn. APK, 2016, vol. 30, no. 3, pp. 46–49.

25. Gultyaeva, E.I. and Sadovaya, A.S., Breeding of wheat for resistance to brown rust in Russia, Zashch. Karantin Rast., 2014, no. 10, pp. 24–26.

26. Tyryshkin, L.G., Gul’tyaeva, Alpat’eva, N.V., and Kramer, I., Identification of effective leaf-rust resistance genes in wheat (Triticum aestivum) using STS markers. Russ. J. Genet., 2006, vol. 42, no. 6, pp. 662–666. https://doi.org/10.1134/S1022795406060111

27. Helguera, M., Khan, I.A., and Dubcovsky, J., Development of PCR markers for wheat leaf rust resistance gene Lr47, Theor. Appl. Genet., 2000, vol. 101, pp. 625–631.

28. McIntosh, R.A., Wellings, C.R., and Park, R.F., Wheat Rusts: an Atlas of Resistance Genes, Australia: CSIRO Publ., 1995.

29. Kumar, A.A. and Raghavaiah, P., Effect of the leaf rust resistance gene Lr28 on grain yield and bread-making quality of wheat, Plant Breed., 2008, vol. 123, no. 1, pp. 35–38. https://doi.org/10.1046/j.1439-0523.2003.00937.x

30. Morgounov, A., Rosseeva, L., and Koyshibayev, M., Leaf rust of spring wheat in Northern Kazakhstan and Siberia: incidence, virulence, and breeding for resistance, Aust. J. Agric. Res., 2007, vol. 58, no. 9, pp. 847–853. https://doi.org/10.1071/AR07086

31. Kroupin, P.Y., Gruzdev, I.V., Divashuk, M.G., Bazhenov, M.S., Kocheshkova, A.A., Chernook, A.G., Dudnikov, M.V., Karlov, G.I., and Soloviev, A.A., Analysis of spring triticale collection for leaf rust resistance genes with PCR markers, Russ. J. Genet., 2019, vol. 55, no. 8, pp. 945–954. https://doi.org/10.1134/S1022795419080088

32. Davoyan, R.O., Bebyakina, I.V., Davoyan, E.R., Mikov, D.S., Badaeva, E.D., Adonina, I.G., Salina, E.A., Zinchenco, A.N., and Zubanova, Y.S., Use of a synthetic form Avrodes for transfer of leaf rust resistance from Aegilops speltoides to common wheat, Vavilov. J. Genet. Breed., 2017, vol. 21, no. 6, pp. 663– 670. https://doi.org/10.18699/VJ17.284

33. Kadkhodaei, M., Dadkhodaie. A., Assad, M.T., Heidari, B., and Mostowfizadeh-Ghalamfarsa, R. Identification of the leaf rust resistance genes Lr9, Lr26, Lr28, Lr34, and Lr35 in a collection of Iranian wheat genotypes using STS and SCAR markers, J. Crop Sci. Biotech., 2012, vol. 15, no. 4, pp. 267–274. https://doi.org/10.1007/s12892-012-0035-9

34. Bipinraj, A., Honrao, B., Prashar, M., Bhardwaj, S., Rao, S., and Tamhankar, Sh., Validation and identification of molecular markers linked to the leaf rust resistance gene Lr28 in wheat, J. Appl. Genet., 2011, vol. 52, pp. 171–175. https://doi.org/10.1007/s13353-010-0026-9

35. Baranova, O.A., Lapochkina, I.F., Anisimova, A.V., Gajnullin, N.R., Iordanskayab, I.V., and Makarova, I.Yu., Identification of Sr genes in new common wheat sources of resistance to stem rust race Ug99 using molecular markers, Russ. J. Genet. Appl. Res., 2016, vol. 6, no. 3, pp. 344–350. https://doi.org/10.1134/S2079059716030011

36. Baranova, O.A., Lapochkina, I.F., Anisimova, A.V., Gajnullin, N.R., Iordanskaya, I.V., and Makarova, I.Yu., Identification of Sr genes in new common wheat sources of resistance to stem rust race Ug99 using molecular markers, Vavilov. J. Genet. Breed., 2015, vol. 19, no 3, pp. 316–322. https://doi.org/10.18699/VJ15.04137

37. Haile, J.K. and Roder, M., Status of genetic research for resistance to Ug99 race of Puccinia graminis f.sp. tritici: a review of current research and implications, Afr. J. Agr. Res., 2013, vol. 8, no. 50, pp. 6670–6680. https://doi.org/10.5897/AJAR2013.7257

38. Kokhmetova, A.M. and Atishova, M.N., Identification of stem rust resistance sources in wheat by using molecular markers, Vavilov. J. Genet. Breed., 2012, vol. 16, no. 1, pp. 132–141.