Genetic diversity of some iranian sweet cherry (Prunus avium) cultivars using microsatellite markers and morphological traits

Farsad A., Esna-Ashari M.

Оригінальна работа 

РЕЗЮМЕ. Целью работы было изучение 23 наиболее важных иранских сортов черешни (Prunus avium), собранных в различных провинциях Ирана, и одного иностранного сорта в качестве контроля для использования в селекционных программах, с помощью 21 микросателлитного маркера и по 27 морфо-логическим признакам. Морфологические признаки образцов листьев, плодов и косточек оценивались на протяжении двух лет подряд. Результаты показали высокую вариабельность исследованных образцов. Большинство важных корреляций затрагивали признаки величины плодов и листьев, а также окраски. Кластерный анализ позволил разделить образцы на две различные группы. Метод главных компонент (Principal component analysis, PCA) качественных и количественных морфологических параметров объяснил более 86.59 % общей вариабельности в первых семи осях. Согласно PCA такие признаки листьев, как длина и ширина, и такие признаки плодов, как длина, ширина и вес, цвет мякоти плода и сока, были предоминантными в первых двух компонентах, что свидетельствует об их важности для определения характеристик зародышевой плазмы черешни. Из 21 SSR маркера 16 были полиморфными, давая 177 аллелей, что варьировало от 4 до 16 аллелей (в среднем 9, 35) со средним уровнем гетерозиготности 0.82. Это давало успешные амплификации и выявило полиморфизм ДНК. Размер аллелей варьировал от 95 до 290 п.н. Кластерный анализ показал, что изученные генотипы черешни классифицируются в пять главных групп, основываясь главным образом на характеристиках вида и данных SSR. В целом наши результаты не показали ясной структуры генетической изменчивости внутри иранской области распространения черешни, так что невозможно сделать выводов об определении границ областей происхождения. Результаты исследования вносят вклад в лучшее понимание генетической изменчивости черешни в Иране, создание более эффективных программ сохранения биоразнообразия и более рациональное планирование работы с репродуктивным материалом.

Ключові слова: genetic relationship; microsatellite; informative markers

Цитологія і генетика 2016, том 50, № 1, C. 12-25

• Department of Biotechnology, Faculty of Agriculture, Ferdowsi University, Mashhad, Iran
• Department of Horticulture, Faculty of Agriculture, Bu Ali Sina University, Hamadan, Iran

E-mail: farsadafsaneh yahoo.com

Farsad A., Esna-Ashari M. Genetic diversity of some iranian sweet cherry (Prunus avium) cultivars using microsatellite markers and morphological traits, Цитологія і генетика., 2016, том 50, № 1, C. 12-25.

В "Cytology and Genetics". Якщо тільки можливо, цитуйте статтю по нашій англомовній версії:
A. Farsad, M. Esna-Ashari Genetic diversity of some Iranian sweet cherry (Prunus avium) cultivars using microsatellite markers and morphological traits, Cytol Genet., 2017, vol. 50, no. 1, pp. 8-19
DOI: 10.3103/S0095452716010059