Цитологія і генетика 2017, том 51, № 3, 32-38
Cytology and Genetics 2017, том 51, № 3, 173–178, doi: https://www.doi.org/10.3103/S0095452717030045

Філогенетичний аналіз українських ізолятів ВЖМК із сої та квасолі

Кириченко А.М., Антіпов І.О., Гринчук К.В.

  • Інститут мікробіології і вірусології ім. Д.К. Заболотного НАН України, Київ
  • Національний університет біоресурсів і природокористування України, Київ

РЕЗЮМЕ. Изучены молекулярно-генетические особенности изолятов вируса желтой мозаики фасоли (ВЖМФ), распространенных в агроценозах Украины. Проведены амплификация, секвенирование и филогенетический анализ фрагментов гена капсидного белка изолятов ВЖМФ, выделенных из растений фасоли (Phaseolus vulgaris L.) и сои (Glycine max L.). Сравнительный анализ секвенированных фрагментов генов показал высокий уровень идентичности исследуемых изолятов и принадлежность их к одному штамму ВЖМФ. Показана высокая степень гомологии с изолятами из России, Австралии и Аргентины. Секвенированные последовательности фрагментов гена белка оболочки украинских изолятов ВЖМФ зарегистрированы в мировом генетическом банке данных под номерами доступа KT923790.1 для изолята из сои и KT923791.1 для изолята из фасоли.

Вивчено молекулярно-генетичні властивості ізолятів вірусу жовтої мозаїки квасолі (ВЖМК), поширених в агроценозах України. Проведено ампліфікацію, секвенування і філогенетичний аналіз фрагментів гена капсидного білка ізолятів ВЖМК, виділених з рослин квасолі (Phaseolus vulgaris L.) та сої (Glycine max L.). Порівняльний аналіз секвенованих фрагментів генів показав високий рівень ідентичності досліджуваних ізолятів і приналежність їх до одного штаму ВЖМК. Показано високий ступінь гомології з ізолятами із Росії, Австралії та Аргентини. Секвеновані послідовності фрагментів гена білка оболонки українських ізолятів ВЖМК зареєстровано у світовому генетичному банку даних за номерами доступу KT923790.1 для ізоляту із сої та KT923791.1 для ізоляту із квасолі.

Ключові слова: потивирусы, изоляты и сиквенсы вируса желтой мозаики фасоли (ВЖМФ), полимеразная цепная реакция с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР)
потівіруси, ізоляти і сиквенси вірусу жовтої мозаїки квасолі (ВЖМК), полімеразна ланцюгова реакція зі зворотною транскрипцією (ЗТ-ПЛР)

Цитологія і генетика
2017, том 51, № 3, 32-38

Current Issue
Cytology and Genetics
2017, том 51, № 3, 173–178,
doi: 10.3103/S0095452717030045

Повний текст та додаткові матеріали

Цитована література