The complete mitochondrial genome of the Rhus gall aphid Nurudea shiraii (hemiptera : aphididae : eriosomatinae)

Shuanqin Yue, Jun Wen, Zhumei Ren

Реферат статті 

РЕЗЮМЕ. Nurudea shiraii, вид галових попелиць, який живе на первинних рослинах-господарях Rhus, формуючи пухлини (гали), багаті на таніни, що широко використовуються у різних сферах. У цьому дослідженні ми провели секвенування та аналіз повного мітохондріального геному (мітогеному) галових попелиць N. shiraii, що вражають Rhus. Послідовність мітогеному складає 15 389 пар нуклеотидів з високим вмістом A + T – 84,1%, включаючи 13 білок-кодуючих генів, два рРНК гени, 22 тРНК гени та один некодуючий контрольний участок (D-петлю). Всі білок-кодуючі гени починаються з типового ATN кодону і закінчуються кодоном TAA, за винятком COI, а також ND4 і ND5, що відрізняються одним залишком T. Філогенез Aphididae дозволяє припустити, що Nurudea shiraii – це сестринська клада для клади з двох інших видів галових попелиць, що вражають Rhus, – Schlechtendalia chinensis та Melaphis rhois – згідно з поточною схемою вибірки.

Ключові слова: Nurudea shiraii, мітохондріон, геном

Цитологія і генетика 2019, том 53, № 4, C. 68-69

1. School of Life Science, Shanxi University, 92 Wucheng Road, Taiyuan Shanxi 030006, China
2. Department of Botany, National Museum of Natural History, Smithsonian Institution, MRC-166, P.O. Box 37012, Washington, DC 20013-7012, U.S.A

E-mail: zmren sxu.edu.cn, renzhum 163.com

Shuanqin Yue, Jun Wen, Zhumei Ren The complete mitochondrial genome of the Rhus gall aphid Nurudea shiraii (hemiptera : aphididae : eriosomatinae), Цитологія і генетика., 2019, том 53, № 4, C. 68-69.

В "Cytology and Genetics". Якщо тільки можливо, цитуйте статтю по нашій англомовній версії:
Shuanqin Yue, Jun Wen, Zhumei Ren The Complete Mitochondrial Genome of the Rhus Gall Aphid Nurudea shiraii (Hemiptera: Aphididae: Eriosomatinae), Cytol Genet., 2019, vol. 53, no. 4, pp. 321–324
DOI: 10.3103/S009545271904011X

Посилання

1. Zhang, G.X., Qiao, G.X., Zhong, T.S., and Zhang, W.Y., Fauna Sinica Insecta, Homoptera: Mindaridae and Pemphigidae, Beijing: Sci. Press, 1999, vol. 14, pp. 282–286.

2. Heie, O.E. and Wegierek, P., Diagnoses of the higher taxa of Aphidomorpha (Hemiptera: Sternorrhyncha), Redia, 2009, vol. 92, pp. 261–269.

3. Avise, J.C., Arnold, J., Ball, R.M., Bermingham, E., Lamb, T., Neigel, J.E., Reeb, C.A., and Saunders, N.C., Intraspecific phylogeography: the mitochondrial DNA bridge between population genetics and systematics, Ann. Rev. Ecol. Sys., 1987, vol. 18, pp. 489–522.

4. Ren, Z.M., Bai, X., Harris, A.J., and Wen, J., Complete mitochondrial genome of the Rhus gall aphid Schlechtendalia chinensis (Hemiptera: Aphididae: Eriosomatinae), Mitochondr. DNA, 2016, vol. 1, no. 1, pp. 849–850.

5. Ren, Z.M. and Wen, J., Complete mitochondrial genome of the North American Rhus gall aphid Melaphis rhois (Hemiptera: Aphididae: Eriosomatinae), Mitochondr. DNA, 2017, vol. 2, no. 1, pp. 169–170.

6. Zimmer, E.A. and Wen, J., Using nuclear gene data for plant phylogenetics: progress and prospects II. Next-gene approaches, J. Syst. Evol., 2015, vol. 53, no. 5, pp. 371–379.

7. Zerbino, D.R. and Birney, E., Velvet: algorithms for de novo short read assembly using de Bruijn graphs, Genome Res., 2008, vol. 18, no. 5, pp. 821–829.

8. Lohse, M., Drechsel, O., Kahlau, S., and Bock, R., Organellar genome DRAW—a suite of tools for generating physical maps of plastid and mitochondrial genomes and visualizing expression data sets, Nucleic Acids Res., 2013, vol. 41, pp. W575–W581.

9. Katoh, K. and Standley, D.M., MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability, Mol. Biol. Evol., 2013, vol. 30, no. 4, pp. 772–780.

10. Stamatakis, A., RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies, Bioinformatics, 2014, vol. 30, no. 9, pp. 1312–1313.